Le filtre est essentiel pour le bon fonctionnement de votre aquarium. Bien que parfois coûteux, il vous servira longtemps et va valloir son investissement. Un aquarium sans filtre a besoin de grands changements d'eau à tout les jours alors qu'avec un filtre, seulement 15% de l'eau par semaine ou 25% aux deux semaines.
Cependant, qui dit filtre dit courant, et les axolotls n'aiment pas le courant. Cela peut les stresser et même les mener à mort. Pour savoir si votre filtre cause trop de courant, il suffit de regarder les branchies des axolotls. Ceux-ci ne doivent pas être en mouvement. Si c'est le cas, vous pourrez diriger le jet contre la vitre/contre la surface.
Le filtre peut être interne comme externe, c'est une question de goût. Il ne faut cependant pas mettre le charbon qui vient avec le filtre puisque celui-ci ne devrait servir que dans certaines circonstances (traitement par exemple)